- Subdirección de Fortalecimiento de Capacidades en Fiscalización Ambiental
- Coordinación de Fiscalías Especializadas en Materia Ambiental
- Subdirección de Seguimiento de Entidades de Fiscalización Ambiental
- Subdirección de Políticas y Mejora Regulatoria
- Coordinación de Sistematización, Estadística y Optimización de Procesos
- Coordinación del Sistema de Información Geográfica
- Dirección de Políticas y Estrategias en Fiscalización Ambiental
- Coordinación del Servicio de Atención a la Ciudadanía
- Coordinación de Imagen Institucional y Prensa
- Coordinación de Relaciones Interinstitucionales
- Oficina de Relaciones Institucionales y Atención a la Ciudadanía
- Oficina de Tecnologías de la Información
- ÓRGANOS DE APOYOEjecución Coactiva
- Coordinación de Recaudación y Control del Aporte por Regulación
- ÓRGANOS DE APOYOUnidad de Finanzas
- Coordinación del Registro y Contratación de Terceros Evaluadores, Supervisores y Fiscalizadores
- Unidad de Abastecimiento
- Secretaría Técnica de Procedimiento Administrativo Disciplinario
- Unidad de Gestión de Recursos Humanos
- Oficina de Administración
- Oficina de Planeamiento y Presupuesto
- Oficina de Asesoría Jurídica
- Procuraduría Pública
- Secretario Técnico del Tribunal de Fiscalización Ambiental
- Vocal de la Sala Especializada en Minería, Energía, Actividades Productivas e Infraestructura y Servicios
