- Oficina Desconcentrada de La Libertad
- Oficina Desconcentrada de Lambayeque
- Oficina Desconcentrada de Junín
- Oficina Desconcentrada de Ica
- Oficina Desconcentrada de Huánuco
- Oficina Desconcentrada de Huancavelica
- Subdirección de Sanción y Gestión de Incentivos
- Subdirección de Fiscalización en Infraestructura y Servicios
- Subdirección de Fiscalización en Actividades Productivas
- Servicio de Información Nacional y Denuncias Ambientales
- Subdirección de Fiscalización en Energía y Minas
- Subdirección de Fortalecimiento de Capacidades en Fiscalización Ambiental
- Dirección de Fiscalización y Aplicación de Incentivos
- Coordinación de Supervisión Ambiental en Residuos Sólidos
- Coordinación de Fiscalías Especializadas en Materia Ambiental
- Subdirección de Seguimiento de Entidades de Fiscalización Ambiental
- Coordinación de Seguimiento y Verificación a las Consultoras Ambientales
- Subdirección de Políticas y Mejora Regulatoria
- Coordinación de Supervisión Ambiental en Agricultura
- Coordinación de Supervisión Ambiental en Industria
- Coordinación de Sistematización, Estadística y Optimización de Procesos
- Coordinación de Supervisión Ambiental en Pesca
- Coordinación del Sistema de Información Geográfica
- Dirección de Supervisión Ambiental en Actividades Productivas
- Coordinación de Supervisión Ambiental en Hidrocarburos