Nicole Sheen Sánchez : "Es necesario intensificar y descentralizar nuestra vigilancia genómica para obtener datos continuos en todo el Perú"

Instituto Nacional de Salud

Bachiller en Genética y Biotecnología, egresada de la maestría en Biología Molecular de la Universidad Nacional Mayor de San Marcos, con Diplomado en Bioinformática y Biología Molecular de la Universidad de Chile, y experiencia en investigación básica.

1.- Srta. Sheen, Ud. ha participado en una pasantía en ciencias, tecnología e innovación tecnológica ¿Cuál ha sido su tema de su estudio y que podría decirnos de esta experiencia?

Sí, participé en una pasantía en ciencia, tecnología e innovación tecnológica en la Universidad de La Frontera en Chile en el 2024, financiada por PROCIENCIA. Fue una oportunidad muy enriquecedora, ya que conté con el asesoramiento continuo del Dr. Michel Abanto, quien posee una amplia experiencia en el área de genómica microbiana.

2.- Coméntenos sobre su labor en labor en el INS y el impacto que considera esta pasantía va a generar en su labor a nivel del laboratorio y otras investigaciones.

Actualmente laboro como asistente de investigación en el Laboratorio de Bacteriología Clínica del INS. Mi pasantía me ha permitido adquirir conocimientos de herramientas bioinformáticas. Esto mejorará los procesos y resultados en el laboratorio y fortalecerá futuras investigaciones en la vigilancia genómica para el INS.

3.- ¿Qué características representa el desarrollo de un análisis en in silico de genes de resistencia y en qué casos se realiza? ¿Cómo desarrolló el procedimiento de la recopilación de las 140 cepas enterobacterianas y cuánto tiempo le tomó la selección de dichas cepas?

El análisis in silico de genes de resistencia implica la identificación y comparación de genes utilizando herramientas bioinformáticas y bases de datos públicos. Este proceso se lleva a cabo en la investigación clínica y salud pública. Se recopilaron 140 cepas enterobacterianas basadas en resultados microbiológicos y pruebas de difusión por disco, seleccionando aquellas resistentes a carbapenémicos y cefalosporinas para realizar el secuenciamiento del genoma completo. Con los datos genómicos obtenidos, se aplicaron diversos programas bioinformáticos, (FastQC, Trimmomatic, Unicycler, Abricate, Microrreact), logrando los resultados en poco tiempo.

4.- ¿En qué casos se recomienda el uso de cefalosporinas y carbapenémicos y qué tipo de contraindicaciones produce?

Tanto las cefalosporinas como los carbapenémicos son efectivos contra una amplia gama de bacterias grampositivas y gramnegativas. No obstante, antes de iniciar cualquier tratamiento con estos antibióticos, se recomienda consultar a un médico y evaluar la susceptibilidad antimicrobiana, ya que estos medicamentos pueden tener contraindicaciones significativas. Entre ellas se incluyen alergias a los betalactámicos, riesgo de toxicidad renal con carbapenémicos y el desarrollo de resistencia bacteriana debido al uso prolongado o inapropiado.

5.-En el en el 2015 se aprobó el Plan de Acción mundial para luchar contra la resistencia a los antimicrobianos, ¿Qué tanto hemos avanzado en nuestro país en el caso de la resistencia antimicrobiana?

Desde la aprobación del Plan de Acción Mundial para combatir la resistencia a los antimicrobianos en el 2015, se han fortalecido las estrategias de concienciación y educación sobre el uso responsable de antibióticos. Además, se ha mejorado la vigilancia epidemiológica para detectar resistencia en laboratorios de referencia nacional y se han implementado medidas más efectivas para controlar infecciones en entornos sanitarios.

6.- La resistencia antimicrobiana tiene un alto impacto en todas las áreas de la salud y es una amenaza para la salud humana, animal y ambiental ¿Piensa que la estrategia aplicada en el país para hacerle frente a este problema está avanzando dentro de los objetivos establecidos, que necesitamos fortalecer?

En nuestro país, se han alcanzado algunos de los objetivos estratégicos establecidos en el plan de acción nacional sobre resistencia a los antimicrobianos. Sin embargo, es necesario intensificar y descentralizar nuestra vigilancia genómica para obtener datos continuos en todo el Perú. Esto nos permitirá mejorar nuestra capacidad de respuesta ante este problema a nivel mundial y garantizar un manejo más efectivo de la resistencia antimicrobiana.

7.-La llegada de la pandemia ha generado una serie de problemas respiratorios en la salud de muchas personas ¿En qué medida esto ha determinado una mayor ingesta de fármacos carbapenémicos y cuáles son los riesgos en la salud de las personas?

La pandemia de COVID-19 ha incrementado el uso de carbapenémicos debido a infecciones bacterianas secundarias en pacientes graves y al uso indiscriminado de antibióticos, fomentando la resistencia bacteriana. Los riesgos incluyen desarrollo de resistencia, efectos secundarios como toxicidad renal y hepática, alteraciones de la microbiota intestinal y alta tasa de mortalidad.

8.- ¿Qué aspectos considera deben fortalecerse y continuarse en el rubro de su investigación?

Me gustaría fortalecer el estudio seleccionando cepas más diversas, no limitadas principalmente a Lima. Los resultados obtenidos se analizarán en conjunto con la asociación entre las pruebas fenotípicas y la espectrometría de masas MALDI-TOF.