Es el órgano de línea que depende de la Dirección General, es responsable de las funciones del sistema de medicamentos de la jurisdicción en coordinación con las unidades orgánicas de la Dirección Regional de Salud y sus órganos desconcentrados.

Unidades orgánicas:

• Dirección de Acceso y Uso Racional de Medicamentos.
• Dirección de Autorizaciones, Control y Vigilancia Sanitaria.