La Dirección de Monitoreo y Evaluación de la Gestión en salud, dependiente de la Dirección General de Operaciones en Salud, es responsable en la elaboración e implementación de normas, lineamientos, mecanismos y planes para realizar el monitoreo y evaluación de la Gestión Administrativa desarrolladas en las Instituciones Prestadoras de Servicios de Salud (Ipress) públicas y Unidades de Gestión de Instituciones Prestadoras de Servicios de Salud (Ugipress) públicas, a nivel nacional.

Asimismo, se encarga de realizar el seguimiento, monitoreo y, de ser el caso, la asistencia técnica correspondiente para el cumplimiento de los servicios brindados en las instituciones (redes, hospitales e institutos especializados), en el marco de convenios de gestión y en coordinación con los órganos técnicos competentes del Ministerio de Salud y los Gobiernos Regionales.