¿Qué es el Secuenciador Genético MinION del Laboratorio de Sanipes?

El Secuenciador Genético MinIONcon el que cuenta el Laboratorio de Sanipes es un equipo portátil de tercera generación que emplea tecnología de nanoporos para analizar ADN en tiempo real, lo que permite detectar de forma oportuna y precisa patógenos recurrentes y nuevos en recursos hidrobiológicos, como trucha, tilapia o langostinos. Esto facilita una rápida respuesta ante brotes que podrían generar enfermedades en la acuicultura.

A su vez, sirve para procesar las muestras biológicas de los tejidos de peces, crustáceos y moluscos. En ese sentido, cuando detectamos mediante Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR) en tiempo real agentes patógenos específicos o la presencia de un brote epidémico desconocido, ya sea viral o bacteriano, aplicamos la Secuenciación de tercera generación con tecnología de nanoporos del MinION para identificar lo conocido o revelar lo desconocido.

Por otra parte, la preparación de la librería para la secuenciación incluye la extracción, fragmentación y reparación del ADN, la adaptación de extremos con adaptadores específicos y la carga en celdas de flujo (flow cells).

Cabe mencionar que el secuenciador genera secuencias en formato POD5 o FASTQ, las cuales se analizan mediante herramientas bioinformáticas especializadas, transformando millones de lecturas genéticas en información útil que nos permite ensamblar genomas, identificar patógenos, detectar genes de resistencia y estudiar factores de virulencia.

Esta tecnología de alta precisión que aplicamos en Sanipes también permite la comparación de cepas locales con otras a nivel mundial y el desarrollo de estrategias de control más efectivas, permitiendo una respuesta rápida ante brotes en la acuicultura. Esto contribuye a la protección de la biodiversidad acuática y al desarrollo sostenible del sector, fortaleciendo la vigilancia sanitaria en el Perú.