La Universidad Nacional del Alto Amazonas, cuenta con las siguientes Facultades y escuelas profesionales respectivas:

1. Facultad de Ciencias Económicas, Administrativas y Contables

• a. Contabilidad
• b. Negocios Internacionales y Turismo

2. Facultad de Ingeniería.

• a. Agronomía
• b. Zootecnia

3. Facultad de ciencias.

• a. Ciencias Biológicas y Acuicultura