- La Gerencia General es el órgano de mayor nivel jerárquico dentro de la estructura organizacional del Servicio de Administración de Inmuebles Municipales de Trujillo – SAIMT. Está a cargo de un funcionario de confianza, denominado Gerente General, quien es designado mediante Resolución de Alcaldía y depende directamente del Alcalde Provincial.
- La Gerencia de Administración y Finanzas es el órgano de apoyo responsable de programar, dirigir, coordinar, controlar y supervisar las acciones correspondientes a las Unidades de Contabilidad, Tesorería, Logística, Personal y Sistemas, así como de administrar los recursos económicos y financieros, en concordancia con la normativa legal vigente. Está a cargo del Gerente de Administración y Finanzas, quien depende directamente de la Gerencia General.
- La Gerencia de Gestión Inmobiliaria es el órgano de línea encargado de administrar la propiedad inmobiliaria municipal, optimizando su comercialización y rentabilidad, así como de conducir los procesos de saneamiento físico-legal, la formulación de proyectos inmobiliarios, y las acciones de mantenimiento, protección y conservación de los inmuebles, en concordancia con el Plan Estratégico Institucional. Está a cargo de un funcionario con categoría de Gerente, quien depende directamente de la Gerencia General.