Organización
Concejo Municipal
Es el órgano máximo de la Municipalidad Distrital de Awajún, que ejerce funciones normativas y fiscalizadoras, además de ejercer funciones de formulación, aprobación y control de la normativa en las materias de competencia del gobierno local, de fiscalización de la gestión y desempeño institucional, de acuerdo a la ley, así como de representación, a través de sus miembros, de los ciudadanos del distrito de Awajún, provincia de Rioja, Región San Martín, esta conformado por el (la) alcalde (sa) y regidores (as).
Alcaldía
Es el máximo órgano ejecutivo de la Municipalidad Distrital de Awajún, encargada de promover el desarrollo sostenible del distrito, ejerce la representación legal, la titularidad del pliego presupuestal y es la máxima autoridad administrativa y política de la Municipalidad Distrital de Awajún, además posee facultades ejecutivas, encargadas de dirigir, evaluar y supervisar el alcance de las metas establecidas de acuerdo a los lineamientos de política derivadas del Concejo Municipal y que estas se encuentren en armonía a lo dispuesto en el artículo 6º de la Ley Nº 27972, Ley Orgánica de Municipalidades, para mejorar las condiciones de vida de los ciudadanos del distrito de Awajún.
Gerente Municipal
Es un órgano de alta dirección de la Municipalidad Distrital de Awajún, encargada de ejecutar y hacer cumplir las políticas del Concejo Municipal y de la Alcaldía, además es el responsable de ejercer la autoridad administrativa y de gestión de calidad de todas las operaciones, inversiones y del funcionamiento de los servicios públicos municipales, con estricta sujeción a las normas legales vigentes para la obtención de los objetivos, metas y resultados proyectados con eficiencia y eficacia por la Municipalidad Distrital de Awajún.
Gerencia de Infraestructura
Es el Órgano de Línea dependiente de la Gerencia Municipal, encargado de planificar, organizar, dirigir y controlar la ejecución de las obras de infraestructura del ámbito urbano y rural, de elaborar y actualizar los planes urbanos y catastro, el otorgamiento de las licencias de construcción. También es responsable de la formulación de estudios de pre inversión, elaboración de expedientes técnicos y la ejecución de obras de infraestructura y su mantenimiento, además de la supervisión, evaluación, pre liquidación y liquidación de las inversiones de su competencia; asimismo de la administración de maquinaria y equipo de propiedad de la municipalidad y de la gestión del riesgo de desastres y defensa civil del distrito. Finalmente, de la administración, organización, monitoreo y mantenimiento del servicio de agua y saneamiento en el distrito de Awajún. Está sujeta al Sistema Nacional de Programación Multianual y Gestión de Inversiones con la responsabilidad de realizar las funciones de Unidad Formuladora (UF) y Unidad Ejecutora de Inversiones (UEI) establecidas por la normatividad de dicho Sistema.
Gerente de Desarrollo Social
Es el Órgano de Línea dependiente de la Gerencia Municipal, encargado de fomentar el desarrollo y bienestar de la comunidad, a través del fortalecimiento y consolidación de las organizaciones sociales de base y la participación vecinal en la de gestión del distrito; además de planificar, dirigir y ejecutar las actividades educativas, de salud, deportivas y culturales; la ejecución de acciones de promoción, defensa de los derechos de la mujer, del niño, del adolescente, de la juventud, grupos étnicos y de los sectores vulnerables y de asistencia e inclusión social; así como al sector poblacional representativo de las comunidades nativas y de los registros civiles, del distrito de Awajún.
Gerente de Desarrollo Económico, Gestión Ambiental y Seguridad Ciudadana
Es el órgano de línea dependiente de la gerencia municipal, encargado de planificar, desarrollar y supervisar los procesos, procedimientos y acciones de conservación y manejo de los recursos naturales y ecosistémicos, los estándares de calidad ambiental, la gestión integral del manejo de residuos sólidos; así como de la zonificación ecológica y económica y el ordenamiento territorial. Además de promover el desarrollo económico local con incidencia en la micro, pequeña y mediana empresa en coordinación con el sector público y privado mediante estrategias de fortalecimiento, desarrollo, promoción y ordenamiento de las actividades productivas, comerciales, industriales, turísticas y de servicios que promuevan empleo, autoempleo y el acceso a nuevos mercados, estableciendo medidas de control y autorizaciones en materia de su competencia. Asimismo, planificar, desarrollar y supervisar los procesos, procedimientos y acciones de seguridad ciudadana, del transporte terrestres y transito vial, conforme a la normativa legal vigente y las políticas emitidas por la alta dirección de la Municipalidad Distrital de Awajún.