La acuicultura en el departamento de Amazonas se enfoca principalmente en la crianza de especies nativas para mejorar la seguridad alimentaria, combatir la desnutrición y generar ingresos en zonas rurales e indígenas.
La acuicultura en Chachapoyas y en la región Amazonas se divide claramente según la geografía de la zona, la cual transita entre la sierra andina y la ceja de selva. En la provincia de Chachapoyas, la actividad acuícola principal está enfocada en el cultivo de agua fría, específicamente en la producción de trucha arcoíris, mientras que en las zonas bajas de la región se fomenta la producción amazónica