El proceso comprende varias etapas: identificación de la medida a consultar, identificación de los pueblos a consultar, así como la etapa de publicidad de la medida, etapa informativa, evaluación interna por parte de los pueblos indígenas y etapa de diálogo.

Durante la etapa informativa, la entidad promotora informa a los pueblos indígenas sobre la medida y las afectaciones a sus derechos colectivos.

Posteriormente, los pueblos realizan su evaluación interna y formulan aportes, propuestas o modificaciones y suscriben un acta. A continuación, se desarrolla el diálogo entre el Estado y los pueblos indígenas para llegar a acuerdos sobre la propuesta de medida.

Finalmente, la entidad toma una decisión, considerando los acuerdos alcanzados y garantizando el ejercicio de los derechos colectivos de los pueblos indígenas.

La PNEIB actualiza la anterior Política Sectorial de Educación Intercultural y Educación Intercultural Bilingüe, que data del 2016 y constituye un instrumento clave para fortalecer una educación de calidad con pertinencia cultural y lingüística.